From 313c597e934801ed1a38a9d1ed727d75a11ca009 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Petr Danecek <pd3@sanger.ac.uk>
Date: Wed, 11 Dec 2024 14:11:56 +0000
Subject: [PATCH] [minor] Sort test output to make output consistent across
 platforms

---
 test/afs.1.1.out | 10 +++++-----
 test/test.pl     |  2 +-
 2 files changed, 6 insertions(+), 6 deletions(-)

diff --git a/test/afs.1.1.out b/test/afs.1.1.out
index 32d10fa1..ca410979 100644
--- a/test/afs.1.1.out
+++ b/test/afs.1.1.out
@@ -1,9 +1,9 @@
+MEAN	 3.333333e-01 6.666667e-01 1.666667e-01 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 1.666667e-01 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00
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 SITE	17	471	T	C	6.543631e+01	1-1-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0
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-SITE	17	3493	CA	C	1.003531e+02	0-0-1-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0
-MEAN	 3.333333e-01 6.666667e-01 1.666667e-01 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 1.666667e-01 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00
+SITE	17	646	A	T	6.543631e+01	0-1-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0-0
 VAR2	 1.000000e+00 1.441327e-03 4.382657e-05 6.160600e-07 1.414270e-08 2.828540e-09 2.357117e-09 2.020386e-09 1.767838e-09 1.571411e-09 1.414270e-09 1.285700e-09 1.178558e-09 1.087900e-09 1.010193e-09 9.428468e-10 8.839188e-10 8.319236e-10 7.857056e-10 7.443527e-10
diff --git a/test/test.pl b/test/test.pl
index cdd00d71..70b89fa9 100755
--- a/test/test.pl
+++ b/test/test.pl
@@ -2165,7 +2165,7 @@ sub test_plugin_afs
     }
     close($fh);
 
-    test_cmd($opts,%args,cmd=>qq[export BCFTOOLS_PLUGINS=$$opts{bin}/plugins; $$opts{bin}/bcftools +afs -a $$opts{tmp}/mpileup.bam.list -f $$opts{path}/mpileup/$ref $args{args}]);
+    test_cmd($opts,%args,cmd=>qq[export BCFTOOLS_PLUGINS=$$opts{bin}/plugins; $$opts{bin}/bcftools +afs -a $$opts{tmp}/mpileup.bam.list -f $$opts{path}/mpileup/$ref $args{args} | sort]);
 }
 sub test_plugin_split
 {